Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GGCXP38435 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms