Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NUP214P35658 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms