Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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HOXD13P35453 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD13P35453 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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