Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GCAP28676 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GCAP28676 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GCAP28676 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GCAP28676 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms