Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PEX2P28328 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PEX2P28328 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PEX2P28328 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms