Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HLA-DMAP28067 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms