Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTSSP25774 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CTSSP25774 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTSSP25774 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTSSP25774 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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