Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HOXB1P14653 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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