Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRF1P14222 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRF1P14222 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms