Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HOXD8P13378 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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