Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMP3P12645 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BMP3P12645 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
BMP3P12645 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
BMP3P12645 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
BMP3P12645 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
BMP3P12645 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BMP3P12645 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms