Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KRT3P12035 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KRT3P12035 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms