Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TOP2AP11388 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms