Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CCDC166P0CW27 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms