Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NSD2O96028 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NSD2O96028 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NSD2O96028 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NSD2O96028 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms