Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PPFIA3O75145 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms