Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTSVO60911 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSVO60911 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms