Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
DENRO43583 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DENRO43583 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DENRO43583 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms