Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SIAH2O43255 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SIAH2O43255 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SIAH2O43255 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SIAH2O43255 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms