Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TO15178 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TO15178 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TO15178 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TO15178 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TO15178 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TO15178 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TO15178 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TO15178 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TO15178 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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