Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLR3AO14802 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3AO14802 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms