Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ERVH48-1M5A8F1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms