Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
B4DXG7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
B4DXG7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
B4DXG7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms