Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SERINC4A6NH21 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SERINC4A6NH21 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms