Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CFAP73A6NFT4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms