Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF316A6NFI3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF316A6NFI3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms