Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms