Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SHOC2Q9UQ13 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms