Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HPS5Q9UPZ3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms