Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
L1RE1Q9UN81 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms