Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED23Q9ULK4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED23Q9ULK4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms