Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRPF3Q9ULD4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms