Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NPC1L1Q9UHC9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NPC1L1Q9UHC9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms