Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDRG3Q9UGV2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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