Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP35Q9P2H5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP35Q9P2H5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
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