Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MED17Q9NVC6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MED17Q9NVC6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms