Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TM7SF3Q9NS93 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms