Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SERINC1Q9NRX5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms