Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CMC2Q9NRP2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMC2Q9NRP2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms