Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHST12Q9NRB3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms