Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
IL1RAPQ9NPH3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms