Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FZD3Q9NPG1 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FZD3Q9NPG1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms