Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PDE7BQ9NP56 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PDE7BQ9NP56 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms