Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGR6Q9HBX8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGR6Q9HBX8 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms