Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CNTD2Q9H8S5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CNTD2Q9H8S5 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms