Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM55Q9BYV6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms