Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CCDC106Q9BWC9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CCDC106Q9BWC9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms