Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
HIGD2AQ9BW72 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms