Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTA3Q9BTC8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms