Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
VAT1Q99536 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAT1Q99536 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms